结果在150株Hp菌株中,胃癌组cagA~+基因型为100.00%,胃炎组为93.41%,且大部分(92.14%)为携带东亚型CagA EPIYA-ABD基序的菌株;胃癌组中vacA s1/m1、vacA s1/m2和babA~+基因型Hp菌株分别占44.07%、55.93%和98.31%,胃炎组分别占48.35%、50.55%和98.90%,差异无统计学意义(PMK-5108细胞系均>0.05)。基于Hp cagA 3′可变区及babA基因序列构建Neighbour-Joining系统进化树,在cagA 3′Cluster I亚群和babA Cluster I亚群中胃癌组Hp菌株,分别占84.48%和80.36%,胃炎组分别为29.27%和39.47%,差异均有统计学意义(P均<0.05)。结论胃癌相关Hp菌株分别不在cagA 3′可变区和babA序列构建的系统进化树上明显聚集成亚群,具有更相似的遗传进化特征。
目的分析四川省西部多房棘球绦虫遗传多态性,对我国西北部地区多房棘球绦虫不同地理亚群的亲缘关系和基因多样性进行探索。方法采用线粒体cox1基因完整序列对四川省西部藏区64份来源于不同生物宿主的多房棘球绦虫样本进行遗传多态性分析,同时收集GSelleckenBank数据库中来源于中国不同地区的多房棘球绦虫的cox1基因序列,比对分析不同地理来源分离株的遗传多态性特征。结果 (1)64份样本共检出5个单倍型,均属于多房棘球绦虫亚洲亚群。单倍型多样性与低核苷酸多样性分别为0.179±0.064和0.00013±0.00005。(2)搜索GenBank数据库,结合本研究中序列信息,共获得181条来源于四川、青海、新疆和内蒙古的多房棘球绦虫cox1基因序列,获得45个单倍型。