G12D c.35G>A,1例13号密码子GGC>GAC突变,p.G13Dc.38G>A,12号密码子突变率占总突变的80%。而LNA-PCR-Sanger法测序,检测的30例胸水样中KRAS突变为6例,突变率为20%(6/30),其中12号密码子突变4例,3例为GGT>GAT突变,p.G12D c.35G>A,1例为GGT>TGT突变,p.G12C c.34G>T,另2例为第14号密码子GTA>ATA,12号密码子突变占总突变的66.67%。LNA-PCR-Sanger法测序检测出KRAS突变的阳性高于焦磷酸法,但P=0.093,无统计学意义。同时进行焦磷酸测序和LNA-PCR-Sanger检测的样本共30例,焦磷酸测序检出KRAS突变为3例,全部为12号密码子突变,GGT>GAT突变,p.G12D c.35G>A,突变率10.00%(3/33),与LNA-PCR-Sanger检测法结果比较,P=0.470,也无统计学意义。 3.肿瘤组织的EGFR/KARS基因突变检测及与胸腔积液检测结果的比较 利用焦磷酸测序对64例NSCLC组织样本进行检测,EGFR基因突变率为34.38%(22/64),与胸腔积液EGFR突变检检出率30.16%(19/63)比较,无统计学意义(P=0.705)。
其中配对的组织和胸腔积液样本24例EGFR突变率分别为37.50%(9/24)和33.33%(8/24),P=0.500,无统计学意义。 利用焦磷酸测序对64例组织样本进行检测,KRAS基因突变率为4.69%(3/64),12号密码子突变2例,占66.7%,13号密码子突变1例,占33.3%。与胸腔积液KRAS突变检检出率(7.93%,5/63)比较,无统计学意义(P=0.350)。 时间 其中配对的组织和胸腔积液样本24例KRAS突变率分别为12.5%(3/24)和8.33%(2/24),P=0.500,无统计学意义。 4. EGFR基因检测与临床相关指标分析 组织样本和胸水标本EGFR基因突变与吸烟史(组织P=0.013,胸水P=0.014)、病理组织学类型(组织P=0.022,胸水P=0,020)相关,非吸烟者、肺腺癌患者更易发生EGFR基因突变。用RECIST标准,对接受TKI靶向治疗的18例患者进行了疗效评价,其中EGFR敏感性突变(19外显子缺失突变和21外显子L858R)共5例,TKI治疗后无CR,PR5例,缓解率RR(CR+PR)为100%;EGFR野生型共13例,TKI治疗后无CR,PR为5例,SD3例,PD5例,缓解率RR(CR+PR)为38.5%。与EGFR野生型患者相比,EGFR敏感性突变患者对TKI临床疗效更加敏感,二者有显著的统计学差异(P=0.029)。
Rigosertib购买 5. KRAS基因检测与临床相关指标分析 组织样本和胸水标本KRAS基因突变与患者的性别、年龄、病例组织学类型、吸烟史等临床病理特征均无明显统计学差异(P>0.05)。用RECIST标准,对接受TKI靶向治疗的18例患者进行了疗效评价,其中KRAS基因突变共1例,达到PR,缓解率RR(CR+PR)为100%;KRAS野生型患者共17例,TKI治疗后无CR,达到PR为9例,SD3例,PD5例,缓解率RR(CR+PR)为56.25%。KRAS基因突变与TKI疗效无明显关系(P=0.556)。该结果与KRAS突变为TKI原发性耐药的西方文献报道有所不同,表明KRAS突变与否与TKI临床疗效相关性可能存在地区差异,需要更大样本的进一步证实。
而且 结论 1.在无法获取组织标本的情况下,胸腔积液可成为NSCLC患者的EGFR/KRAS检测良好的替代。 2.焦磷酸测序可作为EGFR基因突变的检测方法;LNA-PCR-Sanger测序和焦磷酸测序法均可作为胸腔积液的KRAS突变检测,前者更为敏感。 3.与EGFR野生型相比,EGFR基因19、21外显子突变对TKI治疗更敏感。 4. LNA-PCR-Sanger法检测出KRAS突变阳性率高于文献报道,KRAS突变与否与TKI临床疗效无明显关系,与文献报道的KRAS突变为耐药性突变的研究结果有所不同,显示KRAS突变率及与TKI临床疗效相关性可能存在地区差异,需要更大样本的研究。
目的对全反式维甲酸(ATRA)耐药基因HA117在肺癌组织中的表达进行分析,并结合其临床病例资料探讨HA117介导的耐药功能。 材料与方法 一、一般材料 28例非小细胞肺癌组织蜡块来自山东大学齐鲁医院2008-2010年间手术切除的肺癌组织,病史回顾无其他恶性肿瘤史。所有标本均经病理确诊。所有标本均经10%福尔马林液固定,石蜡包埋,行4p连续切片,备用。 二、主要试剂和来源 Ambion RecoverAll Total Nucleic Acid Isolation kit试剂盒OIAGEN公司,M-MLV反转录酶试剂盒购自PROMEGA公司,2×SYBR Premix DimerEvaser试剂盒、Dnase I(Rnase Free)、PCR扩增引物、DL2000DNA Marker分别购自TAKARA公司、Promega公司、ToYoBo公司和Invitrogen公司。 三、方法 应用QRT-PCR技术检测28例肺癌蜡块组织、7例癌旁组织中HAll7基因表达水平,探讨HA117基因在肺癌组织中表达特点。 四、统计学分析 所有数据均采用统计软件SPSS17.0进行处理,非小细胞肺癌与癌旁组织HA117mRNA表达量的比较以及临床病理因素两组间比较采用X2检验和Fisher精确检验,生存分析采用Kaplan-Meier方法,检验水准P取0.05,P60岁)患者组较≤60岁患者高,两组比较有显著统计学差异(P=0.037),腺癌患者高于鳞癌,有统计学差异(P=0.022);HA117mRNA表达在患者性别、分化程度、淋巴结是否转移以及病理分期等因素方面的比较无统计学差异,以上均采用X2检验或Fisher精确检验。HA117mRNA高表达组与低表达组与肿瘤的复发(p=0.372)、预后(p=0.605)无统计学差异(Log-Rank test). 六、结论 1.HA117mRNA在非小细胞肺癌组织中的表达高于癌旁组织,有统计学差异(p60岁)及肺腺癌患者中高表达。 3.HA117mRNA表达水平的高低与患者病情的复发、患者死亡无明显相关性。 4.